Dank den Erfahrungen, die während der ersten Ausgabe des Granfondo San Gottardo gesammelt wurden, haben die Organisatoren vorsichtshalber auch eine alternative Route geplant, sollte wegen dem schlechten Wetter das Rennen auf der ursprünglich geplanten Route über Gotthard-, Furka- und Nufenenpass nicht möglich sein. Die Mitteilung der Routenänderung wird spätestens am Samstag 21. Juli bis 24 Uhr erfolgen.

Die Ersatzroute würde als Erstes, genau wie die ursprüngliche Strecke, auf den Gotthardpass führen.
Oben angekommen, führt die Abfahrt zurück nach Airolo und dann weiter in Richtung Faido (ca. 28 km). Bei den „Piottino"-Kehren geht es nach links, wo der zweite zeitgemessene Abschnitt beginnt.
Der Anstieg nach Carì führt durch die Ortschaften Freggio, Osco und Tarnolgio, diese Strecke ist 9.4 km lang und überwindet einen Höhenunterschied von 800 m.

In Carì beginnt die Abfahrt nach Faido, auf einer breiten und anspruchslosen Strasse.
Ab Faido geht es auf der Kantonsstrasse zurück nach Norden bis Varenzo. Man beachte, dass diese Verlegungsstrecke auch über den ziemlich anspruchsvollen Piottino-Aufstieg führt.

In Varenzo startet der 3. zeitgemessene Abschnitt, bergauf nach Ronco auf der gleichen Strecke der kurzen Variante des Granfondo.

Technische Daten, Variante „alternative" Route

1. Abschnitt mit Zeitmessung: Gotthardpass
Länge: 12 km
Höhenunterschied: 932 m
2. Abschnitt mit Zeitmessung: Aufstieg Piottino-Carì
Länge: 9.4 km
Höhenunterschied: 800 m
3. Abschnitt mit Zeitmessung: Aufstieg Varenzo-Ronco
Länge: 4.8 km
Höhenunterschied: 443 m

Gesamtlänge: 89.7 km
Gesamter Höhenunterschied: 2'175 m